SIL började drivas som projekt 2004 då alla landsting undertecknade ett avtal om finansiering och samarbete. Sedan januari 2009 är SIL i förvaltning hos Sjukvårdsrådgivningen AB.

SKL – Sveriges Kommuner och Landsting kommer att via en beställarledning inneha rollen som uppdragsgivare i relation till SIL. I beställarledningen ingår sex landstingsdirektörer samt representanter från SKL. Beställarledningen har till sitt förfogande en budget för att utveckla nationell IT-struktur för landstingen. Det finns också ett beställarkansli som utgör en samlad resurs för beställarledningens olika uppdrag, däribland SIL.

I SIL ingår en medicinsk referensgrupp vars uppdrag är att utveckla det medicinska innehållet. Under projekttiden har även en nationellt tillsatt styrgrupp med experter inom medicin, farmakologi och IT funnits knuten till SIL.